Estructura Primaria: es simplemente la secuencia de aminoacidos que componen la proteína. Indicandonos cuales de ellos la forman y el orden de los mismos.
Ejemplo de estructura primaria de una proteína en formato FASTA:
>gi|5524211|gb|AAD44166.1| cytochrome b [Elephas maximus maximus] LCLYTHIGRNIYYGSYLYSETWNTGIMLLLITMATAFMGYVLPWGQMSFWGATVITNLFSAIPYIGTNLV EWIWGGFSVDKATLNRFFAFHFILPFTMVALAGVHLTFLHETGSNNPLGLTSDSDKIPFHPYYTIKDFLG LLILILLLLLLALLSPDMLGDPDNHMPADPLNTPLHIKPEWYFLFAYAILRSVPNKLGGVLALFLSIVIL GLMPFLHTSKHRSMMLRPLSQALFWTLTMDLLTLTWIGSQPVEYPYTIIGQMASILYFSIILAFLPIAGX IENY
Estructura Secundaria: Es el primer plegamiento que sufre la proteína. Estructura tridimensional resultante de la interacción mediante enlaces de hidrógeno entre el hidrógeno del grupo Amino y el oxígeno del grupo Carboxilo de los aminoácidos que forman la cadena polipeptídica. Existen dos tipos: Hélice Alfa y Lámina Plegada Beta.
Estructura Terciaria: Plegamiento adicional resultado de las interacciones entre hélices alfa y láminas beta a través de los grupos R y/o entre los grupos R y los grupos Amino o Carboxilo. Una cadena polipeptídica puede tener tramos en hélice alfa y tramos en lámina beta. Son importantes cuatro tipos de interacciones entre estructuras secundarias para formar la terciaria:
- Enlaces de hidrógeno
- Fuerzas de Van der Waals
- Enlaces disulfuro
- Enlaces iónicos
Estructura Cuaternaria: Los primeros tres niveles estructurales se refieren a polipéptidos individuales, pero las proteínas pueden estar formadas por varias cadenas polipeptídicas que interaccionan entre sí. La combinación estructural tridimensional de varios polipéptidos es lo que conocemos como estructura cuaternaria, que coincide con la forma de la proteína en cuestión.
Ejemplo estructura cuaternaria de la hemoglobina:
Podemos apreciar que está formada por dos pares de polipéptidos: cadena alfa y cadena beta. (¡Ojo! Lo de cadena alfa y cadena beta no tiene nada que ver con hélice alfa y lámina beta, ya que todas las estructuras secundarias que se aprecian en este caso son hélices alfa).